The Matrix (MaTrận) là bộ phim khoa học giả tưởng về tương lai. Trong tương lai đó, Thomas, biệt danh Neo, là một hacker luôn có cảm giác khác thường về thế giới thực. Cho tới khi người đàn ông tự xưng là Morpheus tìm đến anh. Người đàn ông này nói cho anh biết, thế giới mà mọi người coi là thực chỉ là một chương trình giả lập để máy móc cai trị con người. Chỉ có một người có thể phá được Ma trận. Những người thật sống sót còn lại cuối cùng và những nhân viên Ma trận đều cùng đi tìm người đó. Và người đó chính là anh – Neo…
The Wachowskis đã bao gồm trong hợp đồng của họ cho những phần tiếp theo của Matrix rằng họ sẽ không phải tham gia bất kỳ cuộc phỏng vấn hay buổi công chiếu nào và họ cũng không phải được chụp ảnh cho mục đích quảng cáo. Họ muốn bộ phim nói lên tất cả.
Ngày 8 tháng 3 năm 2016, bà tiết lộ trong một tuyên bố đến tạp chí Windy City Times rằng bà là người chuyển giới. Trước đây được biết đến với tên Andy Wachowski, bây giờ bà được gọi là Lilly. Điều này xảy ra gần 4 năm sau khi chị gái Lana Wachowski (trước đây được biết đến với tên Larry Wachowski) đã tiết lộ đã thực hiện phẫu thuật xác nhận giới tính.
Cô ấy và chị gái của cô, Lana Wachowski, đã viết một kịch bản mang tên "Carnivore". Kịch bản này đã được đưa vào danh sách "Mười hai kịch bản chưa được sản xuất nổi tiếng nhất Hollywood" của tạp chí Empire. Đến tháng 10 năm 2003, kịch bản này vẫn chưa được sản xuất.
Cô ấy đã đạo diễn một bộ phim được lựa chọn đến Thư viện Quốc gia của Mỹ làm di sản phim quốc gia vì nó được coi là có ý nghĩa "văn hóa, lịch sử hoặc mỹ thuật": Ma trận (1999).
Cha cô ấy là người gốc Ba Lan và mẹ cô ấy có tổ tiên Anh, Scots-Irish, Đức và Pháp.
