Mũi của anh ta đã bị gãy 14 lần được báo cáo đến hiện tại (2018).
Ba mẹ anh ta đều có nguồn gốc từ gia đình người Do Thái Ashkenazi (ông nội của Jon sinh ra ở Munich, Đức và ông tổ tiên khác của Jon đã di cư từ Áo, Nga, Ba Lan và Litva).
Bernthal trích dẫn sự kiện vào năm 2009 như một sự hiểu rõ làm thay đổi cuộc sống của anh ta. Vào năm 2009, một người đàn ông đã say xỉn tóm lấy chó của anh ta. Sau đó, người đàn ông và một số bạn của anh ta bắt đầu theo dõi anh ta về nhà. Sau khi Bernthal đã cảnh báo và họ không lắng nghe, Bernthal đấm hắn ta vào mặt và sau đó bị đưa vào đồn cảnh sát như quả hậu quả. Người bị thương tỉnh dậy, sau đó nhân chứng đã trở lên để nói rằng anh ta đã đe dọa Bernthal trước khi diễn viên này đấm hắn ta.
Một trong hai anh em của Jon là Tom Bernthal, một nhà sản xuất từng đoạt giải Emmy ba lần cho NBC và là người sáng lập kiêm CEO của Kelton Global, một công ty tư vấn kinh doanh.
Những bộ phim yêu thích của anh ấy là The Silence of the Lambs (1991), D.C. Cab (1983), A Prophet (2009), Goodfellas (1990) và True Romance (1993).
